StainIN eco-RED Nucleic Acid Stain

Detailní popis

Stejně snadno se používá, je dvakrát citlivější a mnohem bezpečnější. Toto nové barvivo, které neobsahuje DMSO, je minimálně dvakrát úspornější než konkurenční produkty a ve srovnání s ethidium bromidem jej lze také používat a likvidovat s menšími obavami o životní prostředí a zdraví. StainIN™ eco-RED je fluorescenční barvivo, které umožňuje detekci >0,1 ng DNA v agarózových i polyakrylamidových gelech. Váže se na ds DNA, ssDNA i RNA a vyzařuje červenou fluorescenci detekovatelnou pod LED nebo UV světlem a dokumentovanou stejnými filtry jako ethidium bromid. Pro klonovací aplikace se doporučuje světlo LED. Amesovým testem byla prokázána nižší karcinogenita barviva než u ethidium bromidu.

Karcinogenita a vysoká toxicita široce používaného gelového barviva etidiumbromidu (EtBr) je jedním z největších bezpečnostních a environmentálních problémů v laboratořích, kde je gelová elektroforéza každodenní rutinou. Proto je třeba hledat bezpečnější alternativy ethidium bromidu, které by se používaly v laboratořích. Nová méně toxická barviva nukleových kyselin používaná pro elektroforézu v agarózovém gelu řeší tento problém s bromidem ethidia a minimalizují obavy o životní prostředí.

HighQu StainIN™ eco-RED Nucleic Acid Stain poskytuje výrazně bezpečnější alternativu k ethidium bromidu a zároveň poskytuje až několikanásobně vyšší detekční citlivost. Stejně jako ethidium bromid se barvivo používá během procesu elektroforézy v agarózovém gelu nebo PAAG a (volitelně) v pufru pro elektroforézu, případně pro obarvení gelů po skončení procesu v zásobníku s pufrem.

I přes prokázanou nižší mutagenitu je třeba se všemi barvivy nukleových kyselin zacházet opatrně, protože interagují s DNA a RNA.  Použitý elektroforézní pufr s barvivem i roztavené gely se prohánějí přes schválené (uhlíkové) filtry. Pokud se potvrdí nepřítomnost zbytkové fluorescence, lze kapaliny zlikvidovat velkým množstvím vody do kanalizace.

Alternativně lze všechny použité kapaliny autoklávovat nebo zahřívat, protože barvivo StainIN™ eco-RED Nucleic Acid Stain při dlouhodobém působení teploty nad 100 ºC degraduje.

Pravidelně je třeba konzultovat bezpečnostní úřad, aby odpovídal místním předpisům, protože tyto předpisy se liší a mění. Navzdory testům popsaným v této zprávě nenese prodejce uvedených barviv a dalších činidel žádnou odpovědnost za případné škody vzniklé v důsledku manipulace s jakoukoli prodávanou chemikálií nebo činidlem.

Často kladené otázky týkající se nového barvení nukleových kyselin
1.      Jaké jsou výhody nového barviva StainIN™ eco-RED NA Stain oproti staré verzi StainIN™ RED?

Nové barvivo je čistě vodný roztok. Stará verze StainIN™ RED měla jako rozpouštědlo DMSO.
Nové barvivo je stabilní při pokojové teplotě, dodává se při teplotě okolí. Skladujte ji na elektroforézním stole. Starý StainIN™ RED byl skladován při teplotě +4 °C.
StainIN™ eco-RED NA Stain je flexibilnější - je detekovatelný jak pod UV, tak pod LED světlem.
Pohodlnější protokol - barvivo lze použít jak během běhu gelu, tak jako barvení po běhu.
Stejná nebo lepší citlivost ve srovnání se starým barvením.
2.      Je barva roztoku stejná jako dříve?

Nové barvivo má tmavší odstín červené.

3.      Jaká je koncentrace barviva StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain?

Je 10 000× koncentrovaná, avšak počet aplikací pro barvení po spuštění je obtížné vypočítat, protože v jednom barvicím roztoku lze obarvit více gelů.

4.      Jaké rozpouštědlo se používá v přípravku StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain?

Rozpouštědlo je 100% voda.

5.      Která barviva jsou podobná barvivu StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain?

Nejbližší podobná barviva jsou Ethidium Bromid a GelRed (Biotium).

6.      Jaká je citlivost barviva StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain v ng/pásmu?

Citlivost se pohybuje od 0,1 do 0,3 ng DNA/pásmo nebo i více, v závislosti na faktorech, jako je použitá metoda barvení, zobrazovací schopnost, detekce a tloušťka gelu.

7.      Jaká je emisní vlnová délka barviva StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain?

Emisní vlnová délka je 600 nm.

8.      Jaká je excitační vlnová délka StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain?

Excitační vlnová délka je 300 nm.

9.      Lze StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain použít pro barvení v gelu a v pufru?

Ano, lze jej použít pro barvení v gelu i v pufru po provedení elektroforézy.

10.   Jak by se mělo barvivo používat během gelového běhu v agarózových gelech?

Použijte 8-10 µl barviva ve 100 ml agarosového gelového roztoku vychlazeného na zalití, nic se nepřidává do elektroforetického pufru.

11.   Jak používat StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain s gely PAAGE? Stejně jako u agarózového gelu nebo pomocí protokolu barvení po spuštění.

12.   Lze StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain detekovat pod UV světlem?

Ano, lze jej detekovat pod UV světlem, s ethidium bromidovými nebo GeRed filtry.

13.   Jakou barvu má obarvená DNA v UV světle?

DNA se pod UV světlem jeví jako červenooranžová.

14.   Jakou barvu má RNA v UV světle?

RNA se pod UV světlem jeví jako červenooranžová.

15.   Barví StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain jednořetězcovou i dvouřetězcovou DNA?

Ano, může barvit jak jednořetězcovou, tak dvouřetězcovou DNA a RNA.

16.   Lze obarvenou DNA detekovat pomocí modré LED?

Ano, barvivo StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain - obarvenou DNA lze detekovat pomocí modré LED.

17.   Je StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain kompatibilní s klonováním?

Ano, protože jej lze použít s LED diodou, aniž by došlo k poškození DNA.

18.   Prošlo barvivo StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain testováním toxicity? Ano, je méně toxický než ethylbromid viz zpráva o testování toxicity.

19.   Lze StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain použít k barvení po provedení testu?

Ano, lze jej použít k barvení po provedení testu.

20.   Lze barvicí pufr (elektroforézní pufr s barvivem NA) použít opakovaně?

Ano, barvicí pufr lze použít několikrát, v závislosti na tloušťce gelu a množství obarvené DNA. Měl by být uchováván ve tmě ve skleněné nebo plastové nádobě. Aby nedošlo k absorpci barviva StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain na plastu nebo skle při delším skladování než 24 hodin, připravujte každý den nový barvicí roztok.

21.   Je StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain citlivý na světlo?

Ano, stejně jako všechna ostatní fluorescenční barviva na nukleové kyseliny je StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain citlivý na světlo a měl by být před světlem chráněn.

22.   Lze StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain skladovat při +4 °C?

Doporučené podmínky skladování tohoto barviva jsou okolní teplota přibližně +20 °C.

Vzhledem k běžným chlazeným přepravám však může být krátkodobě vystaveno teplotě +4 °C. Pokud je náhodou zasíláno s chladicími obaly při teplotě +4 °C, jednoduše produkt promíchejte, abyste zajistili úplné rozpuštění mořidla. A dále jej uchovávejte pouze při pokojové teplotě.

23.   Co se stane, pokud bylo barvivo StainIN™ eco-RED Nucleic Acids vloženo nebo vystaveno teplotě -20 °C a bylo zmraženo?

Pokud došlo ke zmrazení, StainIN™ eco-RED Nucleic Acids Stain by měl být zlikvidován a musí být objednán nový produkt. Pokud byl jednou zmražen, nepoužívejte jej.